Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113Q902F9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms