Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms