Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC191Q8NCU4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms