Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms