Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms