Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4N8

P4HA3, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4HA3Q7Z4N8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P4HA3Q7Z4N8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P4HA3Q7Z4N8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P4HA3Q7Z4N8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P4HA3Q7Z4N8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P4HA3Q7Z4N8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P4HA3Q7Z4N8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P4HA3Q7Z4N8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P4HA3Q7Z4N8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P4HA3Q7Z4N8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P4HA3Q7Z4N8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P4HA3Q7Z4N8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms