Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CATSPER4Q7RTX7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms