Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HECW1Q76N89 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HECW1Q76N89 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HECW1Q76N89 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HECW1Q76N89 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HECW1Q76N89 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HECW1Q76N89 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HECW1Q76N89 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HECW1Q76N89 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HECW1Q76N89 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HECW1Q76N89 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HECW1Q76N89 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms