Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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