Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
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