Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USPL1Q5W0Q7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms