Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms