Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRMS1LQ5PSV4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms