Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms