Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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HMGN3Q15651 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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HMGN3Q15651 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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