Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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