Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
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