Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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