Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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