Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms