Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
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ITGA7Q13683 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA7Q13683 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA7Q13683 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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ITGA7Q13683 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA7Q13683 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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ITGA7Q13683 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA7Q13683 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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ITGA7Q13683 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA7Q13683 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA7Q13683 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA7Q13683 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA7Q13683 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA7Q13683 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA7Q13683 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA7Q13683 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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ITGA7Q13683 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA7Q13683 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA7Q13683 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA7Q13683 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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ITGA7Q13683 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA7Q13683 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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ITGA7Q13683 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA7Q13683 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA7Q13683 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA7Q13683 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA7Q13683 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA7Q13683 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGA7Q13683 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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ITGA7Q13683 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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ITGA7Q13683 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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ITGA7Q13683 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGA7Q13683 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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ITGA7Q13683 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGA7Q13683 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGA7Q13683 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGA7Q13683 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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ITGA7Q13683 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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ITGA7Q13683 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGA7Q13683 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGA7Q13683 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGA7Q13683 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGA7Q13683 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGA7Q13683 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGA7Q13683 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGA7Q13683 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGA7Q13683 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGA7Q13683 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGA7Q13683 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGA7Q13683 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGA7Q13683 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGA7Q13683 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGA7Q13683 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGA7Q13683 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGA7Q13683 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGA7Q13683 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGA7Q13683 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGA7Q13683 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGA7Q13683 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGA7Q13683 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGA7Q13683 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGA7Q13683 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGA7Q13683 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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