Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCOF1Q13428 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms