Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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