Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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