Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms