Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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