Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD300CQ08708 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms