Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms