Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms