Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms