Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 KIZ-AS1-202ENST00000443753 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 ETFRF1-201ENST00000381356 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 OR4A19P-201ENST00000533579 1103 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 FGF13-205ENST00000441825 1625 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms