Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BNC1Q01954 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms