Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXOSC10Q01780 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXOSC10Q01780 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXOSC10Q01780 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXOSC10Q01780 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXOSC10Q01780 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXOSC10Q01780 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXOSC10Q01780 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXOSC10Q01780 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXOSC10Q01780 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
EXOSC10Q01780 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXOSC10Q01780 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXOSC10Q01780 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXOSC10Q01780 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXOSC10Q01780 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXOSC10Q01780 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXOSC10Q01780 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXOSC10Q01780 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXOSC10Q01780 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXOSC10Q01780 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXOSC10Q01780 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXOSC10Q01780 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXOSC10Q01780 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXOSC10Q01780 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXOSC10Q01780 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXOSC10Q01780 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXOSC10Q01780 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXOSC10Q01780 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EXOSC10Q01780 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EXOSC10Q01780 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms