Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms