Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZBED6P86452 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED6P86452 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms