Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMF1P82094 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMF1P82094 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMF1P82094 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMF1P82094 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMF1P82094 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMF1P82094 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMF1P82094 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMF1P82094 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMF1P82094 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMF1P82094 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMF1P82094 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMF1P82094 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMF1P82094 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMF1P82094 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMF1P82094 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMF1P82094 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMF1P82094 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMF1P82094 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMF1P82094 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMF1P82094 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMF1P82094 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMF1P82094 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMF1P82094 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMF1P82094 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMF1P82094 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMF1P82094 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMF1P82094 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMF1P82094 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMF1P82094 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMF1P82094 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMF1P82094 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMF1P82094 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMF1P82094 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMF1P82094 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMF1P82094 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMF1P82094 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMF1P82094 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMF1P82094 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMF1P82094 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMF1P82094 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMF1P82094 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMF1P82094 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMF1P82094 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMF1P82094 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMF1P82094 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMF1P82094 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMF1P82094 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMF1P82094 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMF1P82094 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMF1P82094 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMF1P82094 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMF1P82094 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMF1P82094 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMF1P82094 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMF1P82094 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMF1P82094 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMF1P82094 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMF1P82094 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMF1P82094 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMF1P82094 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMF1P82094 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMF1P82094 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMF1P82094 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMF1P82094 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMF1P82094 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMF1P82094 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMF1P82094 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMF1P82094 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMF1P82094 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMF1P82094 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMF1P82094 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMF1P82094 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMF1P82094 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMF1P82094 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMF1P82094 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMF1P82094 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMF1P82094 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMF1P82094 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMF1P82094 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMF1P82094 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMF1P82094 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMF1P82094 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMF1P82094 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMF1P82094 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMF1P82094 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMF1P82094 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMF1P82094 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMF1P82094 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMF1P82094 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMF1P82094 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMF1P82094 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMF1P82094 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMF1P82094 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMF1P82094 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMF1P82094 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMF1P82094 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMF1P82094 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMF1P82094 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMF1P82094 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms