Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRX1P78414 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
IRX1P78414 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRX1P78414 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRX1P78414 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRX1P78414 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRX1P78414 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRX1P78414 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRX1P78414 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRX1P78414 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRX1P78414 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRX1P78414 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRX1P78414 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRX1P78414 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRX1P78414 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRX1P78414 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRX1P78414 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRX1P78414 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRX1P78414 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRX1P78414 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRX1P78414 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRX1P78414 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRX1P78414 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRX1P78414 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRX1P78414 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRX1P78414 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRX1P78414 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRX1P78414 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRX1P78414 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRX1P78414 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRX1P78414 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRX1P78414 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRX1P78414 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRX1P78414 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRX1P78414 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRX1P78414 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRX1P78414 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRX1P78414 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRX1P78414 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRX1P78414 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRX1P78414 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRX1P78414 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRX1P78414 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRX1P78414 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRX1P78414 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRX1P78414 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRX1P78414 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRX1P78414 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRX1P78414 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRX1P78414 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRX1P78414 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRX1P78414 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRX1P78414 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRX1P78414 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRX1P78414 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRX1P78414 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRX1P78414 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRX1P78414 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRX1P78414 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRX1P78414 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IRX1P78414 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRX1P78414 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IRX1P78414 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRX1P78414 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRX1P78414 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms