Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms