Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS28P62857 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS28P62857 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms