Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBP60709 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBP60709 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBP60709 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBP60709 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBP60709 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBP60709 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBP60709 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTBP60709 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTBP60709 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTBP60709 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTBP60709 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTBP60709 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTBP60709 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTBP60709 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTBP60709 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTBP60709 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTBP60709 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTBP60709 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTBP60709 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTBP60709 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTBP60709 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTBP60709 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTBP60709 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTBP60709 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTBP60709 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTBP60709 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTBP60709 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTBP60709 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTBP60709 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTBP60709 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTBP60709 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTBP60709 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTBP60709 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTBP60709 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTBP60709 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTBP60709 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTBP60709 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTBP60709 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTBP60709 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTBP60709 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTBP60709 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTBP60709 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTBP60709 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTBP60709 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTBP60709 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTBP60709 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTBP60709 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTBP60709 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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