Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA9P57773 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA9P57773 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA9P57773 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA9P57773 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA9P57773 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA9P57773 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA9P57773 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA9P57773 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA9P57773 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA9P57773 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA9P57773 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA9P57773 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA9P57773 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA9P57773 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA9P57773 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA9P57773 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA9P57773 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA9P57773 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA9P57773 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA9P57773 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA9P57773 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA9P57773 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA9P57773 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA9P57773 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA9P57773 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA9P57773 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA9P57773 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA9P57773 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA9P57773 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA9P57773 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA9P57773 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA9P57773 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA9P57773 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA9P57773 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA9P57773 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA9P57773 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA9P57773 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA9P57773 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJA9P57773 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJA9P57773 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA9P57773 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA9P57773 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA9P57773 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA9P57773 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA9P57773 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA9P57773 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA9P57773 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA9P57773 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA9P57773 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA9P57773 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA9P57773 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA9P57773 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA9P57773 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA9P57773 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA9P57773 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA9P57773 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA9P57773 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA9P57773 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJA9P57773 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms