Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms