Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPAP49450 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms