Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms