Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNB1P35222 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms