Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA4P35212 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA4P35212 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA4P35212 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA4P35212 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJA4P35212 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA4P35212 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA4P35212 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA4P35212 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA4P35212 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA4P35212 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA4P35212 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA4P35212 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA4P35212 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA4P35212 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA4P35212 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA4P35212 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA4P35212 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA4P35212 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA4P35212 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA4P35212 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA4P35212 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA4P35212 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA4P35212 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA4P35212 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA4P35212 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA4P35212 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA4P35212 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA4P35212 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA4P35212 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA4P35212 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA4P35212 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA4P35212 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA4P35212 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJA4P35212 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GJA4P35212 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA4P35212 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA4P35212 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA4P35212 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA4P35212 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA4P35212 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA4P35212 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA4P35212 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA4P35212 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA4P35212 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA4P35212 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA4P35212 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA4P35212 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA4P35212 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA4P35212 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA4P35212 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA4P35212 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA4P35212 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA4P35212 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA4P35212 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA4P35212 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA4P35212 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA4P35212 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms