Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms