Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms