Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms