Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms